Основные направления работы отдела – координация и обеспечение деятельности закрепленных за отделом организаций в сферах здравоохранения (в т.ч. санаторно-курортное лечение), медицинских наук, дошкольного образования, среднего профессионального образования, библиотечного дела (научные организации и организации научного обслуживания) из числа подведомственных Департаменту организаций.